21 Temmuz 2016 tarihli açıklamaya göre, Fetullahçı Terör Örgütü'nün (FETÖ) darbe girişimiyle ilgili yürütülen soruşturma çerçevesinde, Pamukkale Üniversitesi'nde (PAÜ) görev yapan 43 akademik ve idari personel açığa alındı. Bu karar, kurumun ve devletin güvenliğini sağlama amacını taşımaktadır.